Uygulamaya yüklerken derken? tam olarak ne yapmak istediniz? ne uygulaması? Bildiğim kadarıyla şifre kırmak zor iş. Yöntemleri var ama şifre 3-4 haneden fazlaysa hele hele - / gibi işaretler varsa daha da zorlaşıyor.
Yine de şunu tavsiye edebilirim. PDF dosyası açılabiliyorsa açın. Kaydetmeye izin veriyorsa, save as (farklı kaydet) deyin. Farklı isimle kaydedin. Muhtemelen yeni dosya şifresiz olacak.